دسته بندی و پیش بینی کلاله سه شاخه و چند شاخه زعفران با استفاده از ابزار های آماری یادگیری ماشینی بدون نظارت

نویسندگان

امیرحسین بیکی

استادیارگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم

چکیده

زعفران یک گیاه تریپلوئید و عقیم است که در همه کشورها به عنوان یک ادویه و گیاه دارویی مورد استفاده قرار می گیرد. کلاله مهم ترین قسمت گیاه زعفران می باشد. تاکنون هیچ روش مطمئن مولکولی برای شناسایی و پیش بینی گونه های دارای کلاله سه و چند شاخه ارائه نشده است. در این بررسی بر اساس نشانگر های مولکولی چندشکلی توالی مربوط تکثیر یافته و با استفاده از الگوریتم های بیوانفورماتیکی مختلف،روش های جدیدی برای پیش بینی کلاله زعفران ارائه شده است. پنج آلل m131400، m151200، m151100، m10850 و g6500 به عنوان مهم ترین دسته بندی کننده با دقت پیش بینی بالا بر اساس مدل های attribute weighting انتخاب شدند که دارای پتانسیل بالایی برای خوشه بندی و تشخیص کلاله سه شاخه ازچند شاخه هستند. دسته بندی بدون یادگیری بر اساس الگوریتم های k-means و k-medoids قادر به خوشه بندی صحیح کلاله زعفران هستند. نتایج نشان می دهد که برای اولین بار، روش های داده کاوی می توانند شیوه ای بسیار مؤثر، با دقت و صحت بالای 90 درصد برای تمایز ژنتیکی کلاله سه شاخه از چند شاخه مورد استفاده قرار گیرد. این روش ها می توانند در مکان یابی ژنی و انتخاب به کمک بیومارکرها مورد استفاده قرار گیرند.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

دسته‌بندی و پیش‌بینی کلاله سه‌شاخه و چند‌‌شاخه زعفران با استفاده از ابزار‌های آماری یادگیری ماشینی بدون‌نظارت

زعفران یک گیاه تریپلوئید و عقیم است که در همه کشورها به‌عنوان یک ادویه و گیاه دارویی مورد استفاده قرار می‌گیرد. کلاله مهم‌ترین قسمت گیاه زعفران می‌باشد. تاکنون هیچ روش مطمئن مولکولی برای شناسایی و پیش‌بینی گونه‌های دارای کلاله سه و چند‌شاخه ارائه نشده است. در‌ این بررسی بر ‌اساس نشانگر‌های مولکولی چندشکلی توالی مربوط تکثیر یافته و با استفاده از الگوریتم‌های بیوانفورماتیکی مختلف،روش‌های جدیدی بر...

متن کامل

The Study of Stressful Factors in Clinical Education for Nursing Students Studying in Nursing and Midwifery College in Khorramabad

کچ هدي پ شي مز هني فده و : شزومآ لاب يني شخب ساسا ي شزومآ مهم و راتسرپ ي تسا . و هنوگ ره دوج لکشم ي شزومآ رد لاب يني ، آراک يي هدزاب و ا ني شزومآ زا شخب راچد ار لکشم م ي دنک . فده اب رضاح شهوژپ سررب ي لماوع سرتسا از ي شزومآ لاب يني رد وجشناد ناي راتسرپ ي هدکشناد راتسرپ ي و يامام ي ماـجنا داـبآ مرـخ تسا هتفرگ . شور و داوم راک : رضاح هعلاطم کي هعلاطم صوت يفي عطقم ي تسا . د...

متن کامل

The effect of cyclosporine on asymmetric antibodies and serum transforming growth factor beta1 in abortion-prone model of mice CBA/J x DBA/2

كچ ي هد فده و هقباس : ي ک ي طقس زورب للع زا اه ي ،ررکم ا لماوع تلاخد ي ژولونوم ي ک ا رد ي ن قم طققس عون ي وراد دقشاب ي س ي روپسولک ي ،ن ح لدم رد طقس شهاک بجوم ي ناو ي CBA/j×DBA/2 م ي تنآ ددرگ ي داب ي اه ي ان و راققتم TGF-β لماوع زا عت مهم يي ن گلماح تشونرس هدننک ي سررب روظنم هب رضاح هعلاطم تسا ي ات ث ي ر اس ي روپسولک ي ن م رب ي از ا ي ن تنآ عون ي داب ي س و اه ي اکوت ي ن TGF...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی در زعفران های با بیش از سه کلاله با استفاده از نشانگرمولکولی SSR و ISSR

زعفران زراعی به عنوان با ارزش­ترین ادویه جهان از نظر ژنتیکی کلون مونومورفی بوده، ولی تفاوت­هایی نیز در فنوتیپ و کیفیت گزارش شده است که مهم­ترین تنوع فنوتیپی از نظر زراعی و اقتصادی، وجود گل­های با بیش از سه کلاله است، بنابراین هدف از این تحقیق استفاده از نشانگرهای مولکولی مختلف جهت مطالعه مولکولی زعفران های با بیش از 3 کلاله در منطقه و اندازه­گیری تنوع ژنتیکی بین آن­ها بود. در این تحقیق، کلون­ها...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
زراعت و فناوری زعفران

جلد ۲، شماره ۳، صفحات ۱۹۹-۲۰۴

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023